RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217398.3

PXMP4-201, Transcript of peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PXMP4, Length 979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4-201ENST00000217398 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.09■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.09■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.08■■□□□ 1.29
PXMP4-201ENST00000217398 AOX1Q06278 1338 aa23.08■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 DGKZQ13574 1117 aa23.07■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.07■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.07■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.06■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.06■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.06■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.06■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 UBE4AQ14139 1066 aa23.05■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 DLGAP5Q15398 846 aa23.05■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.05■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 PLIN1O60240 522 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 SPDYE6P0CI01 402 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 TM4SF4P48230 202 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 JAG2Q9Y219 1238 aa23.04■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 SLFN5Q08AF3 891 aa23.03■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 CFAP100Q494V2 611 aa23.03■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.03■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 E9PSI1 815 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 NF2P35240 595 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 GYG1P46976 350 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 MAP3K11Q16584 847 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 FZD1Q9UP38 647 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 PTPRCP08575 1304 aa23.02■■□□□ 1.28
PXMP4-201ENST00000217398 F8W031 263 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.01■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 LRRC24Q50LG9 513 aa23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 USP44Q9H0E7 712 aa23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 OTOFQ9HC10 1997 aa23■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 CLRN2A0PK11 232 aa22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 PRKG1Q13976 671 aa22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 SPRYD7Q5W111 196 aa22.98■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.98■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.98■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 GRIK5Q16478 980 aa22.97■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.97■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 TBC1D8O95759 1140 aa22.96■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.96■■□□□ 1.27
PXMP4-201ENST00000217398 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.95■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 PDE8BO95263 885 aa22.94■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 RASA3Q14644 834 aa22.94■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 UNCXA6NJT0 531 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 MYO1BO43795 1136 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 FGFR2P21802 821 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 SREBF2Q12772 1141 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 TEPSINQ96N21 525 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 VEZTQ9HBM0 779 aa22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.92■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 GPR25O00155 361 aa22.92■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 METTL24Q5JXM2 366 aa22.92■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 WNK4Q96J92 1243 aa22.92■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 GJA5P36382 358 aa22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 CRKP46108 304 aa22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PXMP4-201ENST00000217398 KIF16BQ96L93 1317 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms