RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF561	Q8N587	486 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SPEG	Q15772	3267 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PPY	P01298	95 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FBP1	P09467	338 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TLE4	Q04727	773 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CLN3	Q13286	438 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CHST1	O43916	411 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FCGR3A	P08637	254 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GABRA2	P47869	451 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PSG4	Q00888	419 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDX4	Q13162	271 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RARRES2	Q99969	163 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SCT	P09683	121 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL3	P20749	454 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CALCR	P30988	508 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DYNLT3	P51808	116 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OBSL1	O75147	1896 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LIF	P15018	202 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SULT1A1	P50225	295 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RAC3	P60763	192 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HMGN3	Q15651	99 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MPPED1	O15442	326 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525		E9PLN8	166 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	YIF1A	O95070	293 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IL2RA	P01589	272 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HNF1A	P20823	631 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	BAX	Q07812	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IGFBP7	Q16270	282 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MELTF	P08582	738 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LHX4	Q969G2	390 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	EDEM2	Q9BV94	578 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FABP1	P07148	127 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SULT1A2	P50226	295 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FABP6	P51161	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HFE	Q30201	348 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DEDD	O75618	318 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNA1	P01562	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SRPX	P78539	464 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	NAAA	Q02083	359 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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