RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635137.1

PATJ-215, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PATJ, Length 2,298 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PATJ-215	ENST00000635137	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	ZNF273	Q14593	569 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137		Q6ZR03	302 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PATJ-215	ENST00000635137		A6NLC8	198 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	NDUFA2	O43678	99 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	NXPH2	O95156	264 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CLDN14	O95500	239 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CD74	P04233	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	FCER2	P06734	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	TAS2R46	P59540	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	LGALS8	O00214	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SSNA1	O43805	119 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	IFNA6	P05013	189 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CXCL2	P19875	107 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	GNLY	P22749	145 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	DTYMK	P23919	212 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RAB14	P61106	215 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	STPG2	Q8N412	459 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	PRRT1	Q99946	306 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SH2D1B	O14796	132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SSX5	O60225	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RHBDL1	O75783	438 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OR4A8	P0C604	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CFHR2	P36980	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OR4K15	Q8NH41	348 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	TSPAN5	P62079	268 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	OPCML	Q14982	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137		H7C1Q1	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	DEGS1	O15121	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	AMY2A	P04746	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	NMB	P08949	121 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	AMY2B	P19961	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SERPINF1	P36955	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	GATA4	P43694	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ZNF146	Q15072	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PATJ-215	ENST00000635137	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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