RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602837.1

UBE2E3-211, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 814 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-211ENST00000602837 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 Q6ZPA2 131 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MKXQ8IYA7 352 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FGFRL1Q8N441 504 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 POC1AQ8NBT0 407 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ST8SIA4Q92187 359 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TMEM186Q96B77 213 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 SPSB1Q96BD6 273 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PKIBQ9C010 78 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 NOX4Q9NPH5 578 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CTSZQ9UBR2 303 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CKLFQ9UBR5 152 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DUX4Q9UBX2 424 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CLN8Q9UBY8 286 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ING4Q9UNL4 249 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 LRRC42Q9Y546 428 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 OR2AT4A6NND4 320 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 F8VVB4 439 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 F8VWA3 439 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 H0YIZ8 118 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PIN1P1O15428 100 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 NDUFB3O43676 98 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 NDUFA2O43678 99 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FSTL3O95633 263 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MAS1P04201 325 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 SELLP14151 372 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 NDUFB7P17568 137 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MPZP25189 248 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PSMB9P28065 219 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DUSP1P28562 367 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 BDKRB2P30411 391 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PRDX2P32119 198 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 NPBWR2P48146 333 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 IL24Q13007 206 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TPBGQ13641 420 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 KISS1Q15726 138 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DDI2Q5TDH0 399 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 STUMQ69YW2 141 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF773Q6PK81 442 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 CEP19Q96LK0 163 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 GAFA1Q96PS6 74 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DERL3Q96Q80 235 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MGLLQ99685 303 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 BEX2Q9BXY8 128 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MMP26Q9NRE1 261 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 RASL12Q9NYN1 266 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 A0A0G2JMP0 313 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 A0A0X1KG70 313 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 GABRPO00591 440 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2E3-211ENST00000602837 DVL1O14640 695 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms