RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 GPR21Q99679 349 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 DPY30Q9C005 99 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR51J1Q9H342 316 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR51I1Q9H343 314 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.73□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.73□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 FAM53BQ14153 422 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RAB35Q15286 201 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR8B8Q15620 311 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 C4orf26Q17RF5 130 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 PDFQ9HBH1 243 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 FAM206AQ9NX38 181 aa4.72□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PPI3 338 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR4C46A6NHA9 309 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PDCD5O14737 125 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 TAPBPO15533 448 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 HCRTR1O43613 425 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PLPP2O43688 288 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 B4GALT3O60512 393 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 RAMP2O60895 175 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 STK17BO94768 372 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 MPC2O95563 127 aa4.71□□□□□ -1.66
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