RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	SHBG	P04278	402 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	AQP1	P29972	269 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	DDOST	P39656	456 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR3A4P	P47883	348 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	FABP6	P51161	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	EFNA4	P52798	201 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	HBA1	P69905	142 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC35A1	P78382	337 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	H3F3A	P84243	136 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	MERTK	Q12866	999 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SKP2	Q13309	424 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	GNA13	Q14344	377 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	GNMT	Q14749	295 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	MICB	Q29980	383 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		C9JVG2	144 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		E7EQL1	145 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		E9PBE3	544 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	FAAH	O00519	579 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	HSD17B6	O14756	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	H6PD	O95479	791 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	CRYGB	P07316	175 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		P0C879	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	NPR2	P20594	1047 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF83	P51522	516 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	PRPS1	P60891	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF45	Q02386	682 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5I1	Q13606	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	GK3P	Q14409	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	GABRA6	Q16445	453 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	DGUOK	Q16854	277 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A096LNT2	108 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725		M0R1B8	84 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	PHOX2A	O14813	284 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	BIRC5	O15392	142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	SCN2B	O60939	215 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	VAMP5	O95183	116 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	LGI1	O95970	557 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	BPGM	P07738	259 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2B6	P58173	313 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMOD3-208	ENST00000560725	PLP1	P60201	277 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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