RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 SMIM8Q96KF7 97 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF607Q96SK3 696 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 AGPAT1Q99943 283 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 NICN1Q9BSH3 213 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 RHOFQ9HBH0 211 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 RASL12Q9NYN1 266 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 AHSPQ9NZD4 102 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 V9GYS6 101 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.97□□□□□ -1.77
ATXN3-218ENST00000553309 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 A0A0G2JMM0 328 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1W2PPB8 328 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1W2PRS3 328 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PINLYPA6NC86 204 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 C15orf61A6NNL5 157 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 COLCA2A8K830 154 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 G3V3Y1 287 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SMLR1H3BR10 107 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 K7ERU9 68 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CXCR6O00574 342 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 BCKDKO14874 412 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ORC5O43913 435 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 TYROBPO43914 113 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ICOSLGO75144 302 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CDK2AP2O75956 126 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 MPC2O95563 127 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 MT-ND4LP03901 98 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CD2P06729 351 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR10J4P0C629 311 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 DANCRP0C864 163 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 UROSP10746 265 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF44P15621 663 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 EPORP19235 508 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 GSTM3P21266 225 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SHC1P29353 583 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR3A1P47881 315 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PPOXP50336 477 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CRYBA4P53673 196 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 MLF1P58340 268 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PITPNAQ00169 270 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PLGLB1Q02325 96 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 TAZQ16635 292 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NDUFA9Q16795 377 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 COX19Q49B96 90 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 C5orf47Q569G3 176 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 DET1Q7L5Y6 550 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 LINC01551Q86U37 167 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 CALHM1Q8IU99 346 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NPWQ8N729 165 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NECAP1Q8NC96 275 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 PXT1Q8NFP0 134 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR4S2Q8NH73 311 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 COQ8AQ8NI60 647 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 YIPF6Q96EC8 236 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SMIM10Q96HG1 83 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 RNF157Q96PX1 679 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR2M2Q96R28 347 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 OR8B4Q96RC9 309 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ABHD1Q96SE0 405 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.96□□□□□ -1.78
ATXN3-218ENST00000553309 TUBA4BQ9H853 241 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms