RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NQO2P16083 231 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 CBR1P16152 277 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 HAGHQ16775 308 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM10Q96HG1 83 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CACNG5Q9UF02 275 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 NAT8Q9UHE5 227 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 IGSF23A1L1A6 192 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 MPC2O95563 127 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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