RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 DCTN6O00399 190 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 PDGFAP04085 211 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 PCOLCEQ15113 449 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00596Q86U02 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1D-16P01601 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 OR2B8PP59922 312 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0A6YYJ9 748 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ACSM4P0C7M7 580 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 HARBI1Q96MB7 349 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CDC42EP2O14613 210 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TEX30Q5JUR7 227 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 Q8WTZ3 238 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ITPKCQ96DU7 683 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 STARD10Q9Y365 291 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 AUP1Q9Y679 476 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM127O75204 238 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TGFBR1P36897 503 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 BTG1P62324 171 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CACNG5Q9UF02 275 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 FAM3AP98173 230 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 HGDQ93099 445 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 GPR27Q9NS67 375 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 OIP5O43482 229 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TFPI2P48307 235 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 MUC15Q8N387 334 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 OR1L1Q8NH94 360 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 KLK11Q9UBX7 282 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 NUMA1Q14980 2115 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CST7O76096 145 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TIAF1O95411 115 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 GAMTQ14353 236 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN2O60636 221 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 CBR1P16152 277 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF273Q14593 569 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GREM1O60565 184 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZFPL1O95159 310 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RASL12Q9NYN1 266 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PSG4Q00888 419 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PIGYQ3MUY2 71 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RNF122Q9H9V4 155 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 K7N7A8 449 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF488Q96MN9 340 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 KLK13Q9UKR3 277 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms