RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CENPX	A8MT69	81 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SSX4	O60224	188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CD3D	P04234	171 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF44	P15621	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TBP	P20226	339 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PRDX2	P32119	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	GMFB	P60983	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PAX5	Q02548	391 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TLE4	Q04727	773 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766		Q6ZPA2	131 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766		Q6ZS49	121 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	RDH5	Q92781	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PSPN	O60542	156 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF737	O75373	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FSTL3	O95633	263 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FCGR3A	P08637	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	IRF2	P14316	349 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SPN	P16150	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	AMY2B	P19961	511 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	DYRK2	Q92630	601 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM165	Q9HC07	324 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SIRPB1	O00241	398 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MT-ND4	P03905	459 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	KCNJ3	P48549	501 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MICB	Q29980	383 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	STUM	Q69YW2	141 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	LRBA	P50851	2863 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	LGALS8	O00214	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	RAB3D	O95716	219 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CSN2	P05814	226 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	FCER2	P06734	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	CD80	P33681	288 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	COL10A1	Q03692	680 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-215	ENST00000529766	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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