RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SKA3	Q8IX90	412 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TPPP3	Q9BW30	176 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GTQ1	180 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM74A7	A6NL05	159 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	APOA2	P02652	100 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	VDAC1	P21796	283 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZP4	Q12836	540 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A22	Q9H936	323 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NGB	Q9NPG2	151 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PSG11	Q9UQ72	335 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC30	A6NM36	301 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DVL1	O14640	695 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MPL	P40238	635 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MEOX1	P50221	254 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF92	Q03936	586 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RLF	Q13129	1914 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF345	Q14585	488 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SSPN	Q14714	243 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2A2	Q6IF42	318 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A45	Q8N413	288 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NPAS1	Q99742	590 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZPBP	Q9BS86	351 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IFT22	Q9H7X7	185 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WV48	116 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN34	H7C241	214 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ABCD4	O14678	606 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SPRY3	O43610	288 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C1QL1	O75973	258 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR5G3	P0C626	314 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LIF	P15018	202 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FABP4	P15090	132 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NTF3	P20783	257 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	THBS3	P49746	956 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZP1	P60852	638 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF154	Q13106	437 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF273	Q14593	569 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TIGIT	Q495A1	244 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SEC11C	Q9BY50	192 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SCN4A	P35499	1836 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		G3V3Q6	166 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FCGR3B	O75015	233 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NHLH2	Q02577	135 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		Q3ZCU0	254 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PSME4	Q14997	1843 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		7.05	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPE2	198 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CST2	P09228	141 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BCL3	P20749	454 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CD200	P41217	278 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT55	Q8WUE5	264 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		H0Y8G0	127 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CDIPT	O14735	213 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2A4	O95047	310 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10J4	P0C629	311 aa		7.04	□□□□□ -1.28

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