RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF691Q5VV52 312 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 C11orf88Q6PI97 169 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 C1QL4Q86Z23 238 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 NRG4Q8WWG1 115 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CORO2AQ92828 525 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 Q96MT0 163 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ODAMA1E959 279 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM172BPA6NC97 362 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 GABRPO00591 440 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 LALBAP00709 142 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 IGLV1-47P01700 117 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CSF1P09603 554 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC159P0C7I6 412 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CGB3P0DN86 165 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CGB7P0DN87 165 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF44P15621 663 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CD34P28906 385 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ETV1P50549 477 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TTC23Q5W5X9 447 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 HEPN1Q6WQI6 88 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6ZTK2 550 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 RHOFQ9HBH0 211 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 NEK6Q9HC98 313 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 C8orf4Q9NR00 106 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 DHDHQ9UQ10 334 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A087X0M5 115 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1B0GX30 115 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 HCKP08631 526 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 GNAO1P09471 354 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OCM2P0CE71 109 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CD28P10747 220 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CDK2P24941 298 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 SOX2P48431 317 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 BLCAPP62952 87 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 BDH1Q02338 343 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ELP2Q6IA86 826 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 LYG1Q8N1E2 194 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CHST4Q8NCG5 386 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 Q8NFD4 153 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 PXT1Q8NFP0 134 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 NDNFQ8TB73 568 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 GLS2Q9UI32 602 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 NOTCH1P46531 2555 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 LY6LH3BQJ8 138 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 F2RL2O00254 374 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OPN1MWP04001 364 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OPN1MW2P0DN77 364 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM225BP0DP42 221 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CD24P25063 80 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 HTR1DP28221 377 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 CAPGP40121 348 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 MTNR1BP49286 362 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 SCN1BQ07699 218 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 DOC2BQ14184 412 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 HLA-DRB5Q30154 266 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 KLHL22Q53GT1 634 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ASCL4Q6XD76 172 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR13C5Q8NGS8 318 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ORAI1Q96D31 301 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ING3Q9NXR8 418 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 PITPNC1Q9UKF7 332 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms