RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PPE2 198 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PR64 198 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PRV1 198 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ODAMA1E959 279 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LINC01548A6NM66 108 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MGST3O14880 152 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CDRT1O95170 752 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SERPINA3P01011 423 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV1-47P01700 117 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ISG15P05161 165 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM225BP0DP42 221 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FCGR1AP12314 374 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HTR1DP28221 377 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SSTR5P35346 364 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 GNG10P50151 68 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ETV1P50549 477 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ALDH3A2P51648 485 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KISS1Q15726 138 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 AANATQ16613 207 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FDX2Q6P4F2 183 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 UTS2BQ765I0 119 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SATL1Q86VE3 508 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RFKQ969G6 155 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PHF21AQ96BD5 680 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KIF25Q9UIL4 384 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HHLA2Q9UM44 414 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PPK0 400 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 H0YJX3 145 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LY6LH3BQJ8 138 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SH2D1BO14796 132 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DEGS1O15121 323 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OCM2P0CE71 109 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LIMS3P0CW19 117 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LIMS4P0CW20 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 GLP1RP43220 463 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 REG1BP48304 166 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP10-11P60412 298 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 HNF4GQ14541 408 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF691Q5VV52 312 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF329Q86UD4 541 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 KIRREL1Q96J84 757 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 DUX3Q96PT4 197 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC3-211ENST00000491581 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 SULT1B1O43704 296 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 HTR3BO95264 441 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CYB5AP00167 134 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RBP4P02753 201 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CGB3P0DN86 165 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CGB7P0DN87 165 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRKACBP22694 351 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 VHLP40337 213 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PTGFRP43088 359 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RASSF2P50749 326 aa7.08□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CCR9P51686 369 aa7.08□□□□□ -1.28
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