RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	CDC42	P60953	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		Q8IYB0	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CORO2A	Q92828	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PKIB	Q9C010	78 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LINC01619	G3V211	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		H3BSH0	61 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		J3KTA2	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DLGAP1	O14490	977 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GSTA4	O15217	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	NRAS	P01111	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IGF1	P05019	195 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CDK2	P24941	298 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ACKR3	P25106	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PYCR1	P32322	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IL24	Q13007	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	EBI3	Q14213	229 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GRK1	Q15835	563 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813		Q8N1Y9	231 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MUL1	Q969V5	352 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	NDUFB8	O95169	186 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CNIH1	O95406	144 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF682	O95780	498 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CYB5A	P00167	134 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IFNG	P01579	166 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	LYN	P07948	512 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	GABRR1	P24046	479 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SOX6	P35712	828 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OPRL1	P41146	370 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	PTGFR	P43088	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	P2RX3	P56373	397 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CEP170-216	ENST00000490813	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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