RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	COQ2	Q96H96	371 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ODAM	A1E959	279 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LIMS3	P0CW19	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LIMS4	P0CW20	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CDK2	P24941	298 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	IL18R1	Q13478	541 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	KLHL22	Q53GT1	634 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LPCAT4	Q643R3	524 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	C1QL4	Q86Z23	238 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	JAM3	Q9BX67	310 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM172BP	A6NC97	362 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	DEGS1	O15121	323 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	FBXO24	O75426	580 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	GDNF	P39905	211 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	MTNR1B	P49286	362 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	BDH1	Q02338	343 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CDK5R1	Q15078	307 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF596	Q8TC21	504 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	DPM3	Q9P2X0	92 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	EBAG9	O00559	213 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	IGLV1-47	P01700	117 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OPN1MW	P04001	364 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RAB3A	P20336	220 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CD34	P28906	385 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PTGFR	P43088	359 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	SOX2	P48431	317 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	BLCAP	P62952	87 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571		Q6ZS46	218 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A087X0M5	115 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A1B0GX30	115 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571		H0YJX3	145 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	GABRP	O00591	440 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	BAG2	O95816	211 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CD28	P10747	220 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZSCAN26	Q16670	478 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	XAF1	Q6GPH4	301 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	LEUTX	A8MZ59	168 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571		H3BUI4	141 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	HSPB6	O14558	160 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	MAGEB3	O15480	346 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PEX14	O75381	377 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ALDOB	P05062	364 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CD2	P06729	351 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	DCK	P27707	260 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	BRS3	P32247	399 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	ETV1	P50549	477 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
PGAP2-223	ENST00000489571	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.65	□□□□□ -0.38

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