RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476472.5

ANKRD28-209, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-209ENST00000476472 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MALP21145 153 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 FCARP24071 287 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 COL8A1P27658 744 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 PSMB4P28070 264 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SRIP30626 198 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 HRH1P35367 487 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 WASP42768 502 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GDF5P43026 501 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GPR1P46091 355 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 P2RY1P47900 373 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 STC1P52823 247 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CRISP3P54108 245 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GFRA1P56159 465 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 LCN6P62502 163 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 PSG4Q00888 419 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ROM1Q03395 351 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CXCL9Q07325 125 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 TGIF1Q15583 401 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SYPL1Q16563 259 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MST1LQ2TV78 715 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ALG10Q5BKT4 473 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 VWA2Q5GFL6 755 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 Q6ZN92 141 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 Q6ZSR6 202 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 Q6ZSR9 355 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 BLIDQ8IZY5 108 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 RNF175Q8N4F7 328 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 DEFB125Q8N687 156 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 BAALCQ8WXS3 180 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 C10orf35Q96D05 121 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 C20orf173Q96LM9 149 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SGK494Q96LW2 274 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 IP6K3Q96PC2 410 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 YPEL2Q96QA6 119 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GABRG3Q99928 467 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 LRRC61Q9BV99 259 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MRIQ9BWK5 157 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SIX2Q9NPC8 291 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ACP6Q9NPH0 428 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ASF1AQ9Y294 204 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SZT2Q5T011 3432 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CCDC88CQ9P219 2028 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 KAT6AQ92794 2004 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 METTL12A8MUP2 240 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 UMAD1C9J7I0 102 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 J3KR12 359 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 K7EP34 96 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 NME4O00746 187 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 XKRYO14609 159 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CDC42EP2O14613 210 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 DHHO43323 396 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CHST1O43916 411 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 CLDN11O75508 207 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 DIRAS1O95057 198 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-209ENST00000476472 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms