RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RNF128Q8TEB7 428 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FOXB1Q99853 325 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ABHD6Q9BV23 337 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 A0A087WUJ7 227 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf170A2RU37 121 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 LIPT2A6NK58 231 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 E9PQ18 207 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 DHHO43323 396 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HLA-HP01893 362 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 LCATP04180 440 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 IL11P20809 199 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 S100GP29377 79 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HTR5AP47898 357 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 BATFQ16520 125 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HAGHQ16775 308 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FAM168AQ92567 244 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 NRGNQ92686 78 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 C4orf45Q96LM5 186 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PPH5 198 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FAM221AA4D161 298 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 IFNA4P05014 189 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 KLK2P20151 261 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 CRYGSP22914 178 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RAB32Q13637 225 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FAM189A2Q15884 450 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM104Q8NE00 496 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A28Q96A46 364 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SEH1LQ96EE3 360 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 Q96MF0 132 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 NELFAQ9H3P2 528 aa5.2□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 AQP7P3A6NL99 342 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HS3ST1O14792 307 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 S100A8P05109 93 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ADRA2CP18825 462 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 FMODQ06828 376 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 IKZF1Q13422 519 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SSX2Q16385 188 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF74Q16587 644 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HFEQ30201 348 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SP6Q3SY56 376 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF561Q8N587 486 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TEX29Q8N6K0 151 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RAB1CQ92928 201 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 KIRREL1Q96J84 757 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 CMTM3Q96MX0 182 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 CLCC1Q96S66 551 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 KPTNQ9Y664 436 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC30A6NM36 301 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 A8MXK9 166 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TSTD3H0UI37 97 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF205O95201 554 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 GLRA1P23415 457 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MZT1Q08AG7 82 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MPPED2Q15777 294 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MIDNQ504T8 468 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 UQCC3Q6UW78 93 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 PRO1933Q9H354 126 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 PROK2Q9HC23 129 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 MED9Q9NWA0 146 aa5.19□□□□□ -1.58
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms