RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 SPDL1Q96EA4 605 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MBOAT4Q96T53 435 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 U3KQV3 271 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 SOX15O60248 233 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 P0DMU3 169 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 FAM231AP0DMU4 169 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 FAM231CP0DMU5 169 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CD1BP29016 333 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 GNG10P50151 68 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 SLC18A1P54219 525 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MTPNP58546 118 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 FXYD6P3P58550 94 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TPPP2P59282 170 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 BNIP1Q12981 228 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 RNF148Q8N7C7 305 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 KIRREL1Q96J84 757 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 RHOVQ96L33 236 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 GPR173Q9NS66 373 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 PSG11Q9UQ72 335 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf94C9JXX5 98 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2CO00762 179 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 GSC2O15499 205 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 NRASP01111 189 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 IFNA14P01570 189 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MPZP25189 248 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CD40LGP29965 261 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 OR3A1P47881 315 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 STX1BP61266 288 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ASRGL1Q7L266 308 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 OR2T4Q8NH00 348 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CEP19Q96LK0 163 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MS4A10Q96PG2 267 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TLDC2A0PJX2 215 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 UNC119BA6NIH7 251 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ARPC3O15145 178 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 AESQ08117 197 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 IL24Q13007 206 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 STX3Q13277 289 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 VMACQ2NL98 169 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 HDXQ7Z353 690 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 RDH10Q8IZV5 341 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 UBALD1Q8TB05 177 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TPD52L3Q96J77 140 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 SPACA5Q96QH8 159 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 IFT27Q9BW83 186 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 PEMTQ9UBM1 199 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CD300AQ9UGN4 299 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ODAMA1E959 279 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 F8VVB4 439 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 F8VWA3 439 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 J3KTA2 159 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 BIRC5O15392 142 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEB3O15480 346 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 INMTO95050 263 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 HLA-DRB1P01911 266 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 H2BFMP0C1H6 154 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 KITP10721 976 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CASQ1P31415 396 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 FMO3P31513 532 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 KIR2DS2P43631 304 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 DYRK1AQ13627 763 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 MMDQ15546 238 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TEX30Q5JUR7 227 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 Q5VSD8 79 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 COMMD2Q86X83 199 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 OR10A6Q8NH74 314 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF503Q96F45 646 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 PKIBQ9C010 78 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CST11Q9H112 138 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms