RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 STEAP4Q687X5 459 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 ZNF774Q6NX45 483 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 BAP18Q8IXM2 172 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LGI3Q8N145 548 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SMIM19Q96E16 107 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 HYLS1Q96M11 299 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 BOLA2Q9H3K6 86 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 PRORYQ9H606 182 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 XCL2Q9UBD3 114 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 MBD5Q9P267 1494 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RGS12O14924 1447 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LAMC1P11047 1609 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 BICRAQ9NZM4 1560 aa3.51□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 WNK3Q9BYP7 1800 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FAM166BA8MTA8 275 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LINC01619G3V211 115 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 AIPO00170 330 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 GYG2O15488 501 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 NPIPB7O75200 414 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 HPRT1P00492 218 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 BPGMP07738 259 aa3.5□□□□□ -1.85
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ATRX-204ENST00000460639 HSD17B1P14061 328 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RAB5AP20339 215 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 F2RP25116 425 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 GRPRP30550 384 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 EVX1P49640 407 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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ATRX-204ENST00000460639 CDKN2DP55273 166 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 PPP1CBP62140 327 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FAM53BQ14153 422 aa3.5□□□□□ -1.85
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ATRX-204ENST00000460639 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TEX261Q6UWH6 196 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SLC34A3Q8N130 599 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.5□□□□□ -1.85
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ATRX-204ENST00000460639 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR10A6Q8NH74 314 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CYGBQ8WWM9 190 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 SLC7A6Q92536 515 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 C18orf12Q96KH6 178 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 LINC00052Q96N35 136 aa3.5□□□□□ -1.85
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ATRX-204ENST00000460639 CCDC32Q9BV29 185 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RNF122Q9H9V4 155 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 RASL12Q9NYN1 266 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 VAX2Q9UIW0 290 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-204ENST00000460639 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.5□□□□□ -1.85
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