RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CHST4	Q8NCG5	386 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RDH12	Q96NR8	316 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DHDH	Q9UQ10	334 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		14.26	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FUOM	A2VDF0	154 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HCK	P08631	526 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GLIPR1	P48060	266 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	LOXL3	P58215	753 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	AES	Q08117	197 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF691	Q5VV52	312 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM219	Q86XT9	240 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PXT1	Q8NFP0	134 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MRAP	Q8TCY5	172 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ2	Q96H96	371 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		14.25	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV1-47	P01700	117 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM225B	P0DP42	221 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF44	P15621	663 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HTR1D	P28221	377 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CD34	P28906	385 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MTNR1B	P49286	362 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52W1	Q6IF63	320 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8NFD4	153 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NDNF	Q8TB73	568 aa		14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ODAM	A1E959	279 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK2	P24941	298 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GDNF	P39905	211 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BDH1	Q02338	343 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSCAN26	Q16670	478 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	XAF1	Q6GPH4	301 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		14.23	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087X0M5	115 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GX30	115 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	F2RL2	O00254	374 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRP	O00591	440 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DEGS1	O15121	323 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CGB3	P0DN86	165 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CGB7	P0DN87	165 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB3A	P20336	220 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DCK	P27707	260 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ETV1	P50549	477 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC34A1	Q06495	639 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN1B	Q07699	218 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ASCL4	Q6XD76	172 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF596	Q8TC21	504 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DPM3	Q9P2X0	92 aa		14.22	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BAG2	O95816	211 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGFR	P43088	359 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	BLCAP	P62952	87 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX5	Q02548	391 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	IL13RA2	Q14627	380 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZS46	218 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR148	Q8TDV2	347 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		14.2	□□□□□ -0.14
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YJX3	145 aa		14.2	□□□□□ -0.14

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