RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428222.1

AC004835.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC004835.1, Length 2,907 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004835.1-201ENST00000428222 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF695Q8IW36 515 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TCEAL3Q969E4 200 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 COA4Q9NYJ1 87 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 FOLR3P41439 243 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 Q0VFX4 171 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GNMTQ14749 295 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 EXTL1Q92935 676 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LUZP4Q9P127 313 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ADAMTS20P59510 1910 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 VAMP5O95183 116 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NGFP01138 241 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GAPTQ8N292 157 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SPSB1Q96BD6 273 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.62□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NCKAP5O14513 1909 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ALDH3B1P43353 468 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LGI3Q8N145 548 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 IGSF23A1L1A6 192 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 FAM157AC9JC47 383 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 STARD6P59095 220 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 RAC3P60763 192 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.61□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 MED13Q9UHV7 2174 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PDCD6O75340 191 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GGNQ86UU5 652 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 CACNA1GO43497 2377 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 APOC1P02654 83 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PTAFRP25105 342 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF154Q13106 437 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.6□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 A0A1W2PR80 420 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 MPPED1O15442 326 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GPR137BO60478 399 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LILRA1O75019 489 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 DANCRP0C864 163 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 MLF1P58340 268 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SYT3Q9BQG1 590 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GPR35Q9HC97 309 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NIT2Q9NQR4 276 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ARGFXA6NJG6 315 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF716A6NP11 495 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ZNF724A8MTY0 619 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SYNGR1O43759 233 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ATP6V0CP27449 155 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 VAMP2P63027 116 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 STARD10Q9Y365 291 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 GTF3C1Q12789 2109 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 CEP250Q9BV73 2442 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SELEP16581 610 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 FUT3P21217 361 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 P2RY1P47900 373 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 SULT1A1P50225 295 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.59□□□□□ -0.07
AC004835.1-201ENST00000428222 HIST1H3AP68431 136 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms