RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.32□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.32□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBASA2RRP1 2371 aa8.32□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GWJ7 208 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHISA9B4DS77 424 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PGA5P0DJD9 388 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SERPINF1P36955 418 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PMELP40967 661 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR3A3P47888 321 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL13RA2Q14627 380 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZMYND11Q15326 602 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPV17LQ2QL34 196 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q6P435 159 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYT3Q9BQG1 590 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPA2Q9H2U2 334 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EHFQ9NZC4 300 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF69Q9UC07 566 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.31□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 B9A039 149 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 J3QKU1 62 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSPB6O14558 160 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WNT9BO14905 357 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR4A8P0C604 315 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR4E1P0C645 316 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGFBP2P18065 325 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPY4RP50391 375 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF81P51508 661 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAS2R46P59540 309 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK10Q15131 360 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPPED2Q15777 294 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZFP69Q49AA0 526 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPRNQ5BIV9 151 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POC1AQ8NBT0 407 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TERB2Q8NHR7 220 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RHOFQ9HBH0 211 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ING3Q9NXR8 418 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF222Q9UK12 451 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EDARQ9UNE0 448 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR5H14A6NHG9 310 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRSS44E7EML9 344 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0R233 179 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HS3ST1O14792 307 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NXPH2O95156 264 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARPC4P59998 168 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPAN5P62079 268 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EFNB3Q15768 340 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNJ8Q15842 424 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADIPOQQ15848 244 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C4orf46Q504U0 113 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00596Q86U02 117 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOXA1Q86UR1 476 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8IYB0 196 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RDH5Q92781 318 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LIME1Q9H400 295 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms