RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf73Q69YU5 71 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A14Q9HCY8 104 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMG20AQ9NP66 347 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT84Q9NSB2 600 aa10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087X0M5 115 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GX30 115 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODAMA1E959 279 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6LH3BQJ8 138 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT1C4O75897 302 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC159P0C7I6 412 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T7P0C7T2 308 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA2P29317 976 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR3A4PP47883 348 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIPR1P48060 266 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTCP1P56278 107 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AESQ08117 197 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF329Q86UD4 541 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D1BO14796 132 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOL3O95236 402 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSN2P05814 226 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM106CPP0CH98 169 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF1P18846 271 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKACBP22694 351 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMO1P25800 156 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A1P30531 599 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR3DL2P43630 455 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRX1P54821 245 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZK1IP1Q13113 114 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTS2BQ765I0 119 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH10Q8IZV5 341 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFT1Q96AA3 541 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPSB1Q96BD6 273 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ2Q96H96 371 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPALINQ96PE5 141 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAH7Q8WXX0 4024 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A18PA6NE21 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A16PA6NEW6 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A12PA8MX19 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT19A8MXV4 375 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM4BO94953 1096 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAG2O95816 211 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-12P01611 117 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A15PP0C7V4 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A13PP0C7W8 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A14PP0C7W9 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A24PP0C7X0 464 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF44P15621 663 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR1FP30939 366 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYCNOSP40205 109 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VHLP40337 213 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISL1P61371 349 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTF1Q5T230 341 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF144BQ7Z419 303 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THNSL2Q86YJ6 484 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR56B4Q8NH76 319 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9G1Q8NH87 305 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM40LQ969M1 308 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPEQ96AT9 228 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX4Q99571 388 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP57Q9NU63 452 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ING3Q9NXR8 418 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNG8Q9UK08 70 aa10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF20P17024 532 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFYBP25208 207 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGCR2P98153 550 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53I3Q53FA7 332 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms