RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 AK3Q9UIJ7 227 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MEIOCA2RUB1 952 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FUOMA2VDF0 154 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OVOL3O00110 214 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LYNX1P0DP58 116 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GRK1Q15835 563 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 STUMQ69YW2 141 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CD177Q8N6Q3 437 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GPX8Q8TED1 209 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ST8SIA4Q92187 359 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SNX22Q96L94 193 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CHST6Q9GZX3 395 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DNTTIP1Q9H147 329 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ING3Q9NXR8 418 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KLK11Q9UBX7 282 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PQ09 198 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMPRSS2O15393 492 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM20O43506 726 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ORC5O43913 435 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SSX4O60224 188 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LY6HO94772 140 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DTYMKP23919 212 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LMO1P25800 156 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM33P57088 247 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R19P59542 299 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IL13RA1P78552 427 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SHEQ5VZ18 495 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 STEAP3Q658P3 488 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM185AQ8NFB2 350 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CCL13Q99616 98 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 COL12A1Q99715 3063 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CADP27708 2225 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DSCAMO60469 2012 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MGST3O14880 152 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFB3O43676 98 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TFF1P04155 84 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FCER2P06734 321 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 AMY2BP19961 511 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR3A3P47888 321 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PDLIM4P50479 330 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ATP5J2P56134 94 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ARPC4P59998 168 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 EDDM3AQ14507 147 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ACTBL2Q562R1 376 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC10Q5BKY1 277 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 AVPI1Q5T686 147 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RTN4RL2Q86UN3 420 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 POC5Q8NA72 575 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DYRK2Q92630 601 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM63Q969Q1 353 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SDSLQ96GA7 329 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FAM234AQ9H0X4 552 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM165Q9HC07 324 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SIGLEC5O15389 551 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SSX5O60225 188 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PSPNO60542 156 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFS7O75251 213 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RP2O75695 350 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FSTL3O95633 263 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV2-70P01814 119 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms