RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 UCNP55089 124 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 IGSF11Q5DX21 431 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF826PQ6ZT77 177 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TOMM40LQ969M1 308 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PIGMQ9H3S5 423 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RHOFQ9HBH0 211 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SPACA1Q9HBV2 294 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 BSNQ9UPA5 3926 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF44P15621 663 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ECI1P42126 302 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 FXYD4P59646 89 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 LRP11Q86VZ4 500 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ASB13Q8WXK3 278 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-201ENST00000331789 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.16■□□□□ 0.02
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ACTB-201ENST00000331789 SCTP09683 121 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF728P0DKX0 622 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZS49 121 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 Q8IYB0 196 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 IFT22Q9H7X7 185 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CADP27708 2225 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SIRPB1O00241 398 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CD8AP01732 235 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 DUSP13Q9UII6 198 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.15■□□□□ 0.02
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ACTB-201ENST00000331789 ARPC5O15511 151 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 CRYAAP02489 173 aa15.15■□□□□ 0.02
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ACTB-201ENST00000331789 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-201ENST00000331789 IGF2RP11717 2491 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 C5orf51A6NDU8 294 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 TRDCB7Z8K6 153 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 L7N2F9 121 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 WNT9BO14905 357 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC34A2O95436 690 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 MPC2O95563 127 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR2H2O95918 312 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 GLAP06280 429 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 CCKARP32238 428 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 GLP1RP43220 463 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 POC1AQ8NBT0 407 aa15.14■□□□□ 0.01
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ACTB-201ENST00000331789 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.14■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 A0A0B4J2A0 478 aa15.13■□□□□ 0.01
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ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 ADAP1O75689 374 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 VHLLQ6RSH7 139 aa15.13■□□□□ 0.01
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ACTB-201ENST00000331789 MOB3AQ96BX8 217 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 HES4Q9HCC6 221 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 BET1O15155 118 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 ZNF250P15622 560 aa15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ACTB-201ENST00000331789 PIGPP57054 158 aa15.13■□□□□ 0.01
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