RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MAJINQ3KP22 176 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM240Q5SV17 173 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 RSG1Q9BU20 258 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CEP350Q5VT06 3117 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 FASLGP48023 281 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ABHD16AO95870 558 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ARTNQ5T4W7 220 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 NT5CQ8TCD5 201 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PITX3O75364 302 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GYPAP02724 150 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SPATA45Q537H7 98 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CALHM2Q9HA72 323 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM166BA8MTA8 275 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 HOXB2P14652 356 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TDGF1P3P51864 188 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CEBPEQ15744 281 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PATE1Q8WXA2 126 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 HRKO00198 91 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MPZP25189 248 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CLDN17P56750 224 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MGAMO43451 1857 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 UNC119Q13432 240 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM230Q96A57 120 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TUSC2O75896 110 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 WDR81Q562E7 1941 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 RER1O15258 196 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 IGKV1D-16P01601 117 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 NUBP1P53384 320 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR2A5Q96R48 311 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 IRF2P14316 349 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SPRED2Q7Z698 418 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ENY2Q9NPA8 101 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MKXQ8IYA7 352 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 BMPERQ8N8U9 685 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 PSMF1Q92530 271 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 OR51B6Q9H340 312 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 SIP14410 1827 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CDS2O95674 445 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CEACAM1P13688 526 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 SLC35E1Q96K37 410 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 GDE1Q9NZC3 331 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF253O75346 499 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CEBPBP17676 345 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 THBS4P35443 961 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 PAFAH1B2P68402 229 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 TGFBR3Q03167 851 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 OR4A47Q6IF82 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RAB29O14966 203 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 NRASP01111 189 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 KRASP01116 189 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RAC2P15153 192 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 GJC3Q8NFK1 279 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LMX1AQ8TE12 382 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.57□□□□□ -0.08
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