RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 Q9UFV3 132 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 FZR1Q9UM11 496 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 DBX1A6NMT0 343 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SNAPC5O75971 98 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF81P51508 661 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 Q9N2K0 584 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SLC23A1Q9UHI7 598 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV24A0A0B4J272 114 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0B4J2A0 478 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CDIPTO14735 213 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 CD8AP01732 235 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXD8-201ENST00000313173 SHPKQ9UHJ6 478 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXD8-201ENST00000313173 CCSO14618 274 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 GRPP07492 148 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.76■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 GLP1RP43220 463 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 FAM27E3Q08E93 113 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GWJ7 208 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 C3orf80F5H4A9 247 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 DEGS1O15121 323 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 FCGR2CP31995 323 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.75■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 SPEF1Q9Y4P9 236 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 CRYAAP02489 173 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 RDH5Q92781 318 aa22.74■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.74■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 GMFBP60983 142 aa22.74■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD8-201ENST00000313173 CCKARP32238 428 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 MSMPQ1L6U9 139 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD55Q3KP44 614 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 SPIN3Q5JUX0 258 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 FAM25EA8MYX2 175 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD8-201ENST00000313173 TRDCB7Z8K6 153 aa22.71■■□□□ 1.23
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