RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 C7orf66A4D0T2 115 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 MPGP29372 298 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 HES4Q9HCC6 221 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 NCOR1O75376 2440 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 NTF3P20783 257 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FHL5Q5TD97 284 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 PARP14Q460N5 1801 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF320A2RRD8 509 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TRDCB7Z8K6 153 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 IGFBP7Q16270 282 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 GAPTQ8N292 157 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM230Q96A57 120 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CD1AP06126 327 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 RAB33BQ9H082 229 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CA10Q9NS85 328 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 G3V3Q6 166 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TO15178 435 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 GLRX2Q9NS18 164 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 AGFG2O95081 481 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 VDAC1P21796 283 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 H3F3AP84243 136 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 A0A1W2PP11 408 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 J3QT63 122 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FAM27BQ5VT28 67 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 RGS13O14921 159 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ST8SIA5O15466 376 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 OPN1MWP04001 364 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF250P15622 560 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 B4E171 279 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TGOLN2O43493 480 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 IGF2P01344 180 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TSPAN7P41732 249 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TXN2Q99757 166 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 KLK13Q9UKR3 277 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SYNGR2O43760 224 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CRYBA2P53672 197 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 C17orf51A8MQB3 221 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CHEK1O14757 476 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SP1P08047 785 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 NQO2P16083 231 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM56Q96MV1 263 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A22Q9H936 323 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 RAB7AP51149 207 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ROM1Q03395 351 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 FOXO1Q12778 655 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SKA3Q8IX90 412 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 IL36GQ9NZH8 169 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 hADV38S2A0JD32 116 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CHST1O43916 411 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CTRB1P17538 263 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 KCNK17Q96T54 332 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 PMELP40967 661 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 HFEQ30201 348 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00052Q96N35 136 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 VSIG4Q9Y279 399 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-201ENST00000308580 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms