RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 MLF1P58340 268 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 GNB1P62873 340 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SPEM2Q0P670 501 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 HES3Q5TGS1 186 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM65Q6PI78 240 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 OR2D2Q9H210 308 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 KLF4O43474 513 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CDS2O95674 445 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LYPD8Q6UX82 237 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 PATE3B3GLJ2 98 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ST8SIA5O15466 376 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ACTL6AO96019 429 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEA5P43359 124 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 OR5B3Q8NH48 314 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC29Q8WV35 223 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0U1RQV5 110 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 C21orf140B9A014 251 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SYNGR2O43760 224 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LURAP1Q96LR2 239 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.44■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CXCL2P19875 107 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CT45A10P0DMU9 189 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FOXO1Q12778 655 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 PIGYQ3MUY2 71 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TEX30Q5JUR7 227 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 GAPTQ8N292 157 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TXN2Q99757 166 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1456Q9P272 454 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FZR1Q9UM11 496 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ISG15P05161 165 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 GLRX2Q9NS18 164 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 R4GN57 208 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CHST1O43916 411 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 AARDQ4LEZ3 155 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LYG1Q8N1E2 194 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A45Q8N413 288 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 OR5A2Q8NGI9 324 aa15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 KLK10O43240 276 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 THY1P04216 161 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 MPGP29372 298 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM104Q8NE00 496 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 J3QT63 122 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 YIF1AO95070 293 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 IFITM2Q01629 132 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.42■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 BCL3P20749 454 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CSN1S1P47710 185 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ZXDAP98168 799 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1FQ16864 119 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO17Q96EF6 278 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 OTOFQ9HC10 1997 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 NDUFB3O43676 98 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 DYNLT3P51808 116 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 ACY3Q96HD9 319 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SHISA3A0PJX4 238 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CDIPTO14735 213 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CD200P41217 278 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 RAB7AP51149 207 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SEC11CQ9BY50 192 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SDK2Q58EX2 2172 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1W2PP11 408 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 SPINK2P20155 84 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 C3AR1Q16581 482 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC10Q5BKY1 277 aa15.41■□□□□ 0.06
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB124Q8NES8 71 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms