RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM123Q8N131 208 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 R3HDM4Q96D70 268 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CDC42EP2O14613 210 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 KLK10O43240 276 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SYNGR2O43760 224 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NXPH3O95157 252 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 BMP5P22003 454 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NRN1LQ496H8 165 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF320A2RRD8 509 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FFAR1O14842 300 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 LURAP1Q96LR2 239 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR2T8A6NH00 312 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CRYBA1P05813 215 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GAB4Q2WGN9 574 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NEURL2Q9BR09 285 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PQF6 199 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MASP2O00187 686 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FCGR3BO75015 233 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-34P06331 123 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF83P51522 516 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ERVFC1-1P60608 527 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM45BQ96B21 275 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 IGSF23A1L1A6 192 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CSF2RBP32927 897 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 PMELP40967 661 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FAM3AP98173 230 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 VAX2Q9UIW0 290 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 HSF4Q9ULV5 492 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 PSG11Q9UQ72 335 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FOXS1O43638 330 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CXorf1O96002 111 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FOXC1Q12948 553 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 LYPD8Q6UX82 237 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR5R1Q8NH85 324 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM10Q96HG1 83 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RNF122Q9H9V4 155 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ACSM6Q6P461 480 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SCMH1Q96GD3 660 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CACNG5Q9UF02 275 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SCN9AQ15858 1988 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 C7orf66A4D0T2 115 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 HPRT1P00492 218 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR5AC1P0C628 307 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OPRK1P41145 380 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 Q3ZCU0 254 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 WNT2BQ93097 391 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZG16BQ96DA0 208 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ARID2Q68CP9 1835 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 H0Y980 276 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 NQO2P16083 231 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MC5RP33032 325 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TGFBR1P36897 503 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 LGALS7P47929 136 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 P2RX3P56373 397 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SERF2P84101 59 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SPEM2Q0P670 501 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms