RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231061.8

SPARC-201, Transcript of secreted protein acidic and cysteine rich, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPARC, Length 3,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARC-201ENST00000231061 DEFB134Q4QY38 66 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TMUB2Q71RG4 321 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 PFN4Q8NHR9 129 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 PIGCQ92535 297 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 BTF3L4Q96K17 158 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SYT3Q9BQG1 590 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 COL4A3Q01955 1670 aa7.3□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 J3QLW9 94 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 XRCC3O43542 346 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 GCGP01275 180 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ZNF19P17023 458 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MTNR1BP49286 362 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CAMPP49913 170 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FOXE3Q13461 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 EFNB3Q15768 340 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SLC36A2Q495M3 483 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 AWAT2Q6E213 333 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TEX101Q9BY14 249 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 A0A1W2PQM1 296 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MPZL1O95297 269 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 THY1P04216 161 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 HRH1P35367 487 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 GABRA2P47869 451 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 DUSP5Q16690 384 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 MRGPREQ86SM8 312 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR10G6Q8NH81 332 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CA10Q9NS85 328 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FGF21Q9NSA1 209 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CLEC1BQ9P126 229 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 A0A1W2PRS3 328 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FUT3P21217 361 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TBX15Q96SF7 602 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ASB6Q9NWX5 421 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 A0A1W2PPK0 400 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 DEGS1O15121 323 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 APODP05090 189 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 GYPBP06028 91 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 SRD5A2P31213 254 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR10A3P58181 314 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FOXL1Q12952 345 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 NSDHLQ15738 373 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 NIPAL3Q6P499 406 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 COX18Q8N8Q8 333 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR5W2Q8NH69 310 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 Q8WTZ3 238 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 FGF13Q92913 245 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 OR10C1Q96KK4 312 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.28□□□□□ -1.24
SPARC-201ENST00000231061 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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