RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 ISOC2Q96AB3 205 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 TMEM202A6NGA9 273 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 NDUFB3O43676 98 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 FAHD1Q6P587 224 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MUC15Q8N387 334 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 OR4S2Q8NH73 311 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 MRAP2Q96G30 205 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 DAPP1Q9UN19 280 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.28□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 CCR2P41597 374 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 IL24Q13007 206 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 UBE2V2Q15819 145 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 Q7L0L9 218 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 ABCA3Q99758 1704 aa8.27□□□□□ -1.08
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TMEM33P57088 247 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 HSF4Q9ULV5 492 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SERTM1A2A2V5 107 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 CXorf1O96002 111 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 AESQ08117 197 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 OTOSQ8NHW6 89 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PPC4 97 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 CDAP32320 146 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZNF519Q8TB69 540 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 CTAG2O75638 210 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SFT2D2O95562 160 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 B3GALT4O96024 378 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RAG2P55895 527 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TCTN1Q2MV58 587 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 FRG2CA6NGY1 282 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 HOXA6P31267 233 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SPRY3O43610 288 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 DAOP14920 347 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LGALS7P47929 136 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 FAM117AQ9C073 453 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.27□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 K7ESM1 405 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 OR4C3Q8NH37 302 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SPSB1Q96BD6 273 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RAB32Q13637 225 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 B4E171 279 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 UBE2L6O14933 153 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 KISS1Q15726 138 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 MPV17LQ2QL34 196 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 DNAL4O96015 105 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 VSIG4Q9Y279 399 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ARID2Q68CP9 1835 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 FGF17O60258 216 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 GALP22466 123 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 VAX2Q9UIW0 290 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 B9D1Q9UPM9 204 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A1P53007 311 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 GNG3P63215 75 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PRSS8Q16651 343 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LEMD1Q68G75 181 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms