RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrm2Q9CPY0 246 aa11.41□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa11.41□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9817Q9D2M0 144 aa11.41□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2dnl1A2AFH1 155 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan15F7BWT7 294 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a9P28571 692 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf9bQ6NZA9 249 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 QpctlQ8BH73 383 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mef2cQ8CFN5 474 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P2rx2Q8K3P1 485 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr473Q8VG44 310 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S1pr5Q91X56 400 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sf3b5Q923D4 86 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spsb1Q9D5L7 273 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mn1D3YWE6 1297 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NrtnP97463 195 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbp2Q08652 134 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec12bQ149M0 275 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm773Q3TML4 206 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr5Q60889 312 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Flywch1Q8CI03 673 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt16Q9JJ61 558 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Samt3A2ARK7 233 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14409A2ARR8 349 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpm1O70152 260 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taar9Q5QD04 348 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk1b21Q61759 261 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem158Q6F5E0 286 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 March1Q6NZQ8 289 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1456Q80WQ4 447 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lgi3Q8K406 548 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx18Q91ZR2 614 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r27Q9D119 154 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lin37Q9D8N6 246 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dtd1Q9DD18 209 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TpbgQ9Z0L0 426 aa11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl8A2AUU0 281 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Susd1E9Q3H4 752 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PomcP01193 235 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr83P30731 423 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhodP97348 210 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasl2-9Q61820 216 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr215Q8VF82 310 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CmipQ9D486 773 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt13Q9EQT6 426 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hnf4gQ9WUU6 408 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrnA0A075B668 197 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Awat1A2ADU9 328 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 6330409D20RikA2AK85 162 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1348F6VB59 318 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cops3O88543 423 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhrs3O88876 302 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01667 111 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NfyaP23708 346 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gng3P63216 75 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss43Q76HL1 382 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnd1Q8BLR7 232 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdadc1Q8BMD5 523 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nmnat2Q8BNJ3 307 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhf2Q91WB4 249 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpx4Q91XR9 253 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spred1Q924S8 444 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrndQ9QUG3 179 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcne3Q9WTW2 103 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PoleQ9WVF7 2283 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r180B9EK86 305 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btg1P62325 171 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrc1Q3UPH1 443 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnase11Q5GAM9 192 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1447Q8VFX3 309 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ropn1lQ9EQ00 218 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpffQ9WVA8 114 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r57K7N731 310 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifna7P06799 190 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas2r41P59532 308 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem211Q3UUA0 195 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1106Q7TR57 312 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube3dQ8BX13 368 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pars2Q8CFI5 475 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FkrpQ8CG64 494 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r72Q8K3N7 306 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl3Q99N95 348 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam96bQ9D187 163 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dda1Q9D9Z5 102 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bap18Q9DCT6 171 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PthQ9Z0L6 115 aa11.39□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm29776A0A286YEC0 699 aa11.38□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1039A2ARY0 319 aa11.38□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm15446D3Z5Y8 553 aa11.38□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm43191F6YIH5 235 aa11.38□□□□□ -0.59
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ms4a18J3QN01 344 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.1 ms