RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX7A1	P24310	79 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	MIDN	Q504T8	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYRK2	Q92630	601 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0YJX3	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSPN	O60542	156 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2H2	O95918	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDOB	P05062	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTNR1B	P49286	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNT4	P56705	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSU1	Q15404	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	LALBA	P00709	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBP4	P02753	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OMG	P23515	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	BDKRB2	P30411	391 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	AQP4	P55087	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZP1	P60852	638 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIPK1	Q13546	671 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q499Y3	187 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		13.53	□□□□□ -0.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GUS0	222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	GABRP	O00591	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR137B	O60478	399 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTR3B	O95264	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEL	P19835	753 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	LMO1	P25800	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	P2RX3	P56373	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.52	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0G2JK05	382 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARG1	P05089	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDK1	P06493	297 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGFR	P43088	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR3A1	P47881	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAG2	P55895	527 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	THRSP	Q92748	146 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSX3	Q99909	188 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.51	□□□□□ -0.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms