RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 SGK3Q96BR1 496 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ORAI1Q96D31 301 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 V9GYH0 126 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPN1MWP04001 364 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM16LQ309B1 348 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPSB1Q96BD6 273 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCG5Q9H222 651 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GHRLQ9UBU3 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A0A6YYH2 397 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 A6NJ64 397 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAHP00439 452 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR157Q5UAW9 335 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 NAA40Q86UY6 237 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q8N402 240 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTX4Q96A99 478 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHST5Q9GZS9 411 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRRQ9GZT4 340 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GGT3PA6NGU5 568 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ICMTO60725 284 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 BPNT1O95861 308 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 BPIFB3P59826 476 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 FGF12P61328 243 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNB2P62879 340 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB12Q6IQ22 244 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF529Q6P280 563 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPSB4Q96A44 273 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTTG1O95997 202 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV4-59P01825 116 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD37P11049 281 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB6AP20340 208 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 POU3F4P49335 361 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRSS12P56730 875 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q6ZSV7 163 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 POC5Q8NA72 575 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 HAVCR1Q96D42 359 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GFI1Q99684 422 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB22AQ9UL26 194 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 STARD10Q9Y365 291 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CENPXA8MT69 81 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTDSPLO15194 276 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 NRASP01111 189 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL7P13232 177 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANOS1P23352 680 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GSK3AP49840 483 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP1B3P54709 279 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 AP3S2P59780 193 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR176Q14439 515 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 P2RY14Q15391 338 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 AWAT2Q6E213 333 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 RFT1Q96AA3 541 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 BORCS8Q96FH0 119 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 LYZL4Q96KX0 146 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 SOSTQ9BQB4 213 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms