RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 FUOMA2VDF0 154 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 E9PQ18 207 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 H3BNX3 289 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 H3BUI4 141 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MMP23AO75900 390 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGKV1D-12P01611 117 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR3A1P47881 315 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC34A1Q06495 639 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 AESQ08117 197 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 GALEQ14376 348 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 RNF144BQ7Z419 303 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 LYG1Q8N1E2 194 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CBR4Q8N4T8 237 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 C4orf36Q96KX1 117 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR5M11Q96RB7 305 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ALG8Q9BVK2 526 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF702PQ9H963 129 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 NEK6Q9HC98 313 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A0G2JK05 382 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 F2RL2O00254 374 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 PEX14O75381 377 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 FBXO24O75426 580 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 KDM4BO94953 1096 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR2H2O95918 312 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MT-ND2P03891 347 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 HCKP08631 526 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMEM225BP0DP42 221 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CD28P10747 220 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF44P15621 663 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 GABRB1P18505 474 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 LMO1P25800 156 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 HTR1DP28221 377 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 GLIPR1P48060 266 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 DYNLT3P51808 116 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 P2RX3P56373 397 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 BLCAPP62952 87 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR52W1Q6IF63 320 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 Q8N2B8 174 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CORO2AQ92828 525 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 Q96MT0 163 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 AMBNQ9NP70 447 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ING3Q9NXR8 418 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM172BPA6NC97 362 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 E9PI62 339 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 G3V4G9 280 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 DEGS1O15121 323 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 MPZL2O60487 215 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 ALX3O95076 343 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OPN1MWP04001 364 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 CDK2P24941 298 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 IL18R1Q13478 541 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 KISS1Q15726 138 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 Q6P435 159 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 Q6ZS46 218 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 SYS1Q8N2H4 156 aa7.12□□□□□ -1.27
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms