RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589626.5

FBXL12-208, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 12, human

TSL 2 BASIC

Gene FBXL12, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXL12-208	ENST00000589626	LPAR6	P43657	344 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	UCP3	P55916	312 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM33	P57088	247 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	PSG4	Q00888	419 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	HGFAC	Q04756	655 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM187	Q14656	261 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	LGI3	Q8N145	548 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
FBXL12-208	ENST00000589626	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	CXCL13	O43927	109 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PDCD6	O75340	191 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	HFE	Q30201	348 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	MSTN	O14793	375 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	NDUFA2	O43678	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	GPR137B	O60478	399 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FBXO24	O75426	580 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	DUSP1	P28562	367 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	SOX8	P57073	446 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FXYD4	P59646	89 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	HERV-K104	P61576	105 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626		Q6ZRG5	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PSMF1	Q92530	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	APC2	O95996	2303 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626		H7C1Q1	480 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	HEXA	P06865	529 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ITGA3	P26006	1051 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	HMGN3	Q15651	99 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	LIME1	Q9H400	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	MED12	Q93074	2177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	CYTIP	O60759	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	SRPX	P78539	464 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF92	Q03936	586 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PIGC	Q92535	297 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A0G2JMM0	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A1W2PPB8	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A1W2PRS3	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	CD5	P06127	495 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	FUT3	P21217	361 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	GDF1	P27539	372 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	NTF4	P34130	210 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	P2RY1	P47900	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FBXL12-208	ENST00000589626	NPBWR1	P48145	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms