RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PNR3 127 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LRP5LA4QPB2 252 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 M0QYG6 137 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RER1O15258 196 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZIC3O60481 467 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CYTIPO60759 359 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GLAP06280 429 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FGF2P09038 288 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CTXN2P0C2S0 81 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ABOP16442 354 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CRYGSP22914 178 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 S100GP29377 79 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ATP1B3P54709 279 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R1AQ13522 171 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZS49 121 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C3orf56Q8N813 242 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAM222BQ8WU58 562 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RNF141Q8WVD5 230 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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GGA3-218ENST00000584243 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BORCS8Q96FH0 119 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 AQP10Q96PS8 301 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C5orf51A6NDU8 294 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR2AT4A6NND4 320 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF724A8MTY0 619 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 F8VVB4 439 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 F8VWA3 439 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RAD51DO75771 328 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FCGR2AP12318 317 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GNB3P16520 340 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CNR1P21554 472 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ARR3P36575 388 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GLP1RP43220 463 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 UCP3P55916 312 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MTCP1P56278 107 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ARG2P78540 354 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MALLQ13021 153 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ACER2Q5QJU3 275 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CARD17Q5XLA6 110 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TMEM42Q69YG0 159 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MOB3CQ70IA8 216 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 AAED1Q7RTV5 226 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CD163Q86VB7 1156 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 COMMD1Q8N668 190 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BVESQ8NE79 360 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SPSB4Q96A44 273 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C2orf50Q96LR7 162 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 Q96M66 194 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BCO1Q9HAY6 547 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 VSIG4Q9Y279 399 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.93□□□□□ -1.3
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