RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WNT10AQ9GZT5 417 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMG20AQ9NP66 347 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 H3BUI4 141 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SH2D1BO14796 132 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC16A6O15403 523 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ISG15P05161 165 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HTR1AP08908 422 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM95Q3KNT9 176 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4F4Q96R69 305 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MBOAT4Q96T53 435 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 XPNPEP2O43895 674 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALDOBP05062 364 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IL18R1Q13478 541 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4P4Q8NGL7 312 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR10AC1Q8NH08 325 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPACA5Q96QH8 159 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HHLA2Q9UM44 414 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2H2O95918 312 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV1D-12P01611 117 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OXLD1Q5BKU9 147 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FDX2Q6P4F2 183 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABHD12Q8N2K0 398 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR51A4Q8NGJ6 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR5D18Q8NGL1 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NEK6Q9HC98 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FUOMA2VDF0 154 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM90A22PA8MWA6 464 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 J3QLW9 94 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 J3QRE1 110 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF19P17023 458 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR52W1Q6IF63 320 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DPM3Q9P2X0 92 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM172BPA6NC97 362 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALPLP05186 524 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF44P15621 663 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDK2P24941 298 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCR9P51686 369 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCN1BQ07699 218 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AESQ08117 197 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF144BQ7Z419 303 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF596Q8TC21 504 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C4orf36Q96KX1 117 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EI24O14681 340 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KDM4BO94953 1096 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD24P25063 80 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GLIPR1P48060 266 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FBLN7Q53RD9 439 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HEPN1Q6WQI6 88 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 REC114Q7Z4M0 266 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACBD7Q8N6N7 88 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STMN2Q93045 179 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PELI1Q96FA3 418 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ING3Q9NXR8 418 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MT-ND2P03891 347 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BRS3P32247 399 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q6ZPA2 131 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AKR1E2Q96JD6 320 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAS2R3Q9NYW6 316 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1W2PRX2 142 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNTNA6NMZ2 147 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4C45A6NMZ5 311 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMO1P25800 156 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGDIBP52566 201 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BDH1Q02338 343 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C16orf82Q7Z2V1 217 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR5AU1Q8NGC0 362 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SGCDQ92629 289 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CORO2AQ92828 525 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AASSQ9UDR5 926 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms