RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SYTL3Q4VX76 610 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TP53I3Q53FA7 332 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CT45A1Q5HYN5 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RTL6Q6ICC9 239 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 OSR2Q8N2R0 312 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A15Q8N5U1 240 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 OR4N2Q8NGD1 307 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR1S2Q8NGQ3 325 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 CT45A3Q8NHU0 189 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC19Q96DA6 116 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 LYZL4Q96KX0 146 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IL17FQ96PD4 163 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EBPLQ9BY08 206 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 ACP6Q9NPH0 428 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MUTYHQ9UIF7 546 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GX51 115 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN11A1L157 253 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE12JA6NER3 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 E9PLN8 166 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 J3QR89 54 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MYL12BO14950 172 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T1O43869 369 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 H2BFMP0C1H6 154 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5AC1P0C628 307 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE12FP0CL80 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE12GP0CL81 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE12IP0CL82 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SELEP16581 610 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNB2P17787 502 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 AOC1P19801 751 aa2.59□□□□□ -1.99
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