RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK1A	O00322	258 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MFNG	O00587	321 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PLIN3	O60664	434 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RDH16	O75452	317 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXH1	O75593	365 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RP2	O75695	350 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BGLAP	P02818	100 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CD5	P06127	495 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IL3	P08700	152 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5G3	P0C626	314 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00614	P0C842	121 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNE1	P15382	129 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAC1	P20366	129 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DDT	P30046	118 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ADORA1	P30542	326 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR7	P32248	378 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CD70	P32970	193 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RCVRN	P35243	200 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	APLNR	P35414	380 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GGT2	P36268	569 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TCL1A	P56279	114 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R43	P59537	309 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SPCS3	P61009	180 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA20	P61599	178 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL6	P80162	114 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IFITM3	Q01628	133 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNX3	Q13761	415 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIQK	Q629K1	86 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LEMD1	Q68G75	181 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	STRADA	Q7RTN6	431 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35G3	Q8N808	338 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8WTZ3	238 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf33	Q8WU49	177 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IL22RA2	Q969J5	263 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	YIPF5	Q969M3	257 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35B4	Q969S0	331 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BTF3L4	Q96K17	158 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP170P1	Q96L14	293 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EBPL	Q9BY08	206 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST5	Q9GZS9	411 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51E2	Q9H255	320 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BATF3	Q9NR55	127 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GID8	Q9NWU2	228 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG5	Q9Y673	324 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ASTN1	O14525	1302 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLUH	O75153	1309 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CPD	O75976	1380 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		2.05	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PGP	A6NDG6	321 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KLLN	B2CW77	178 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DISC1	C4P0D8	188 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF878	C9JN71	531 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CHP2	O43745	196 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF253	O75346	499 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VENTX	O95231	258 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EPPIN	O95925	133 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CA2	P00918	260 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHG2	P01859	326 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CECR9	P0C854	216 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2F2	P13984	249 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OMG	P23515	440 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PRTN3	P24158	256 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	AGTR1	P30556	359 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN2B	P42772	138 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR3A4P	P47883	348 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT2	P49753	483 aa		2.04	□□□□□ -2.08

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