RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533811.1

PACS1-214, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-214ENST00000533811 SLC35B1P78383 322 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MED21Q13503 144 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HES1Q14469 280 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZNF596Q8TC21 504 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SLAMF9Q96A28 289 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 RAX2Q96IS3 184 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SNX22Q96L94 193 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TEAD3Q99594 435 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HES4Q9HCC6 221 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZFP57Q9NU63 452 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 FAM206AQ9NX38 181 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 F8VVB4 439 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 F8VWA3 439 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 H3BN98 237 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 H3BSH0 61 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TOR1AO14656 332 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DHRS3O75911 302 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CDK2P24941 298 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SLC6A1P30531 599 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CEACAM3P40198 252 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MNDAP41218 407 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HNF4GQ14541 408 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 LPCAT4Q643R3 524 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CEP19Q96LK0 163 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CIB1Q99828 191 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ACOD1A6NK06 481 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HAND1O96004 215 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 FAM106CPP0CH98 169 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CALCBP10092 127 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MPZP25189 248 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DUSP1P28562 367 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 GDNFP39905 211 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DAPP51397 102 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 AQP4P55087 323 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ERVK11-1P61568 191 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 BDH1Q02338 343 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 IL24Q13007 206 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TTC23Q5W5X9 447 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OR52W1Q6IF63 320 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 KRT74Q7RTS7 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CBR4Q8N4T8 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 MROQ9BYG7 248 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 PKIBQ9C010 78 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ING3Q9NXR8 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 GLS2Q9UI32 602 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HHLA2Q9UM44 414 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 SIRPB1O00241 398 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 DLGAP1O14490 977 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 IGLV3-1P01715 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TTRP02766 147 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ALPLP05186 524 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 OSMP13725 252 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 TMEM11P17152 192 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 ALOX5APP20292 161 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 NFYBP25208 207 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-214ENST00000533811 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.28□□□□□ -1.24
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