RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	SERPINA2	P20848	420 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PTGFR	P43088	359 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MAP2K4	P45985	399 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	HILS1	P60008	231 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	BAMBI	Q13145	260 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	IRF3	Q14653	427 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MGST3	O14880	152 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	DEGS1	O15121	323 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CDRT1	O95170	752 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	VENTX	O95231	258 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GPR50	Q13585	617 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TRAM1	Q15629	374 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1W2PRD5	423 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1W2PRF3	423 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1W2PRM7	423 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	HSPB6	O14558	160 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF737	O75373	536 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GPX5	O75715	221 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CCL3L1	P16619	93 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ACTG1	P63261	375 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	KLRD1	Q13241	179 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GPR176	Q14439	515 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MUL1	Q969V5	352 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MGLL	Q99685	303 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PSPN	O60542	156 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PAH	P00439	452 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PRTN3	P24158	256 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	OR3A1	P47881	315 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	DLX1	P56177	255 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF273	Q14593	569 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	INSL4	Q14641	139 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059		Q8N7P7	452 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	MDFI	Q99750	246 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CHID1-222	ENST00000533059	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59

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