RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM215	Q68D42	235 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	C16orf87	Q6PH81	154 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	YPEL4	Q96NS1	127 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		0.27	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760		A0A075B6Q4	140 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SLC22A20	A6NK97	555 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PLPP3	O14495	311 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SLC37A4	O43826	429 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GCG	P01275	180 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SOD3	P08294	240 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PSKH1	P11801	424 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TAC1	P20366	129 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	G6PC	P35575	357 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEA1	P43355	309 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RAD51	Q06609	339 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GPR176	Q14439	515 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CDNF	Q49AH0	187 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ARL6	Q9H0F7	186 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	LYRM4	Q9HD34	91 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	TFR2	Q9UP52	801 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PTPRK	Q15262	1439 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760		F8VP50	259 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	HTR2B	P41595	481 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CLDN6	P56747	220 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR4A5	Q8NH83	315 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ISOC2	Q96AB3	205 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC77	Q9BR77	488 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	DDIT4	Q9NX09	232 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PRG6	482 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR2AT4	A6NND4	320 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	RLN2	P04090	185 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	M6PR	P20645	277 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CD9	P21926	228 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CRABP1	P29762	137 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	EVI2B	P34910	448 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	HCCS	P53701	268 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJC3	Q13217	504 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	APOF	Q13790	326 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	DOC2A	Q14183	400 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	BEX5	Q5H9J7	111 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GLYAT	Q6IB77	296 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT10	Q86SR1	603 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CPB2	Q96IY4	423 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GPR22	Q99680	433 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ROS1	P08922	2347 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	IGSF23	A1L1A6	192 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	ERLIN1	O75477	346 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	AGT	P01019	485 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GYPC	P04921	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	GUSB	P08236	651 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEA12	P43365	314 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	MLF1	P58340	268 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CDK1-208	ENST00000519760	CTAG1A	P78358	180 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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