RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 FOXC1Q12948 553 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 Q6ZSR3 168 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SSX9Q7RTT3 188 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 POC1AQ8NBT0 407 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 NUDT8Q8WV74 236 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 GALNT14Q96FL9 552 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 Q96M66 194 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR8B2Q96RD0 313 aa5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 A0A0G2JK05 382 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 C9orf170A2RU37 121 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TMEM235A6NFC5 223 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 B4DEV8 164 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LIPFP07098 398 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 UCP2P55851 309 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 PSG4Q00888 419 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TIGITQ495A1 244 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 NUP37Q8NFH4 326 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OR8U1Q8NH10 309 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MOB3AQ96BX8 217 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 CMBLQ96DG6 245 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 RNF5Q99942 180 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 I3L521 148 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 CD3DP04234 171 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SEC11BP0C7V7 166 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 VSIG8P0DPA2 414 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 HRH1P35367 487 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LHX2P50458 406 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 CLDN18P56856 261 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 FXYD4P59646 89 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SERF2P84101 59 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 AANATQ16613 207 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 COMMD7Q86VX2 200 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 FAM222BQ8WU58 562 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 C12orf49Q9H741 205 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 H3BMH7 237 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 HRKO00198 91 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 HAND1O96004 215 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 PTHLHP12272 177 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 NDUFB7P17568 137 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MAS1LP35410 378 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 PSMB3P49720 205 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SELENOPP49908 381 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ASCL4Q6XD76 172 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 Q9N2K0 584 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 MANBALQ9NQG1 85 aa5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 A0A0A6YYJ9 748 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ZNF716A6NP11 495 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 C9orf172C9J069 976 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 ATP6V1G1O75348 118 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 SERPINF1P36955 418 aa5.07□□□□□ -1.6
POLK-215ENST00000514141 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms