RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RFT1Q96AA3 541 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 HMG20AQ9NP66 347 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 NECAP2Q9NVZ3 263 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 FRRS1LQ9P0K9 344 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.56□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PRX2 142 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 H3BUI4 141 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR2H2O95918 312 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1D-12P01611 117 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZNF20P17024 532 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CDC42P60953 191 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CD83Q01151 205 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 IL18R1Q13478 541 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 RNF144BQ7Z419 303 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OPALINQ96PE5 141 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 DPM3Q9P2X0 92 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.55□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 FAM172BPA6NC97 362 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 SH2D1BO14796 132 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 ISG15P05161 165 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OCM2P0CE71 109 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CDK2P24941 298 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 LOXL3P58215 753 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR52W1Q6IF63 320 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 HEPN1Q6WQI6 88 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR10AC1Q8NH08 325 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 STMN2Q93045 179 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 PHF21AQ96BD5 680 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 SPSB1Q96BD6 273 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 RNFT2Q96EX2 444 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 SPACA5Q96QH8 159 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 MBOAT4Q96T53 435 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 DAPL1A0PJW8 107 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 J3QRE1 110 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 KDM4BO94953 1096 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 BRS3P32247 399 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 GDNFP39905 211 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 GLIPR1P48060 266 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 RASSF2P50749 326 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 BDH1Q02338 343 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 AESQ08117 197 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 FDX2Q6P4F2 183 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZNF596Q8TC21 504 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 CORO2AQ92828 525 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 LIN7BQ9HAP6 207 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 HHLA2Q9UM44 414 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-211ENST00000513325 FUOMA2VDF0 154 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 LEUTXA8MZ59 168 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A6O15403 523 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 IGLV1-47P01700 117 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 HTR1AP08908 422 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ZNF44P15621 663 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 IGLL1P15814 213 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 CD33P20138 364 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 LMO1P25800 156 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 SCN1BQ07699 218 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 FOXB2Q5VYV0 432 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 WFDC9Q8NEX5 89 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 OR13C3Q8NGS6 347 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ZNF286AQ9HBT8 521 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 NEK6Q9HC98 313 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ING3Q9NXR8 418 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ODAMA1E959 279 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 J3QLW9 94 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 LPLP06858 475 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 PF4V1P10720 104 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ZNF19P17023 458 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 CCR9P51686 369 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 Q6P435 159 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-211ENST00000513325 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.51□□□□□ -0.25
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