RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IL13RA2	Q14627	380 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM65	Q6PI78	240 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR6S1	Q8NH40	331 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR51I2	Q9H344	312 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FZR1	Q9UM11	496 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		V9GYS6	101 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EPOP	A6NHQ4	379 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR7C2	O60412	319 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM11	O75078	769 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PPY	P01298	95 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-13	P01766	116 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-7	P01780	117 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RAB4A	P20338	218 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF90	Q03938	601 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C3AR1	Q16581	482 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	AWAT1	Q58HT5	328 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	WNT2B	Q93097	391 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LURAP1	Q96LR2	239 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TAAR9	Q96RI9	348 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	UCK1	Q9HA47	277 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1H	O95180	2353 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YW62	118 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CYTIP	O60759	359 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IL2RA	P01589	272 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LPAR6	P43657	344 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CHST5	Q9GZS9	411 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPH5	198 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PR64	198 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRV1	198 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		M0R1B8	84 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CHST1	O43916	411 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LYZL6	O75951	148 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	STPG2	Q8N412	459 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	S1PR3	Q99500	378 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PROCR	Q9UNN8	238 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF320	A2RRD8	509 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		F6UZH7	168 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A18	H0YCH9	400 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		M0R1X1	148 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BMP5	P22003	454 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	H3F3A	P84243	136 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HOGA1	Q86XE5	327 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GAPT	Q8N292	157 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PTX4	Q96A99	478 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RAB40C	Q96S21	281 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	KCNK17	Q96T54	332 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SHISA7	A6NL88	538 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MB	P02144	154 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CRYBA1	P05813	215 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FST	P19883	344 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR3A1	P47881	315 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NPBWR1	P48145	328 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DYNLT3	P51808	116 aa		7.06	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		7.06	□□□□□ -1.28

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