RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495899.1

MRPL55-233, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 2

Gene MRPL55, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-233	ENST00000495899	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	PRKACA	P17612	351 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	CEL	P19835	753 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	LMO1	P25800	156 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	BAMBI	Q13145	260 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	SPHAR	Q15513	63 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	ELP2	Q6IA86	826 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	CHST4	Q8NCG5	386 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899		Q8NFD4	153 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPL55-233	ENST00000495899	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GABRP	O00591	440 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FST	P19883	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CRHBP	P24387	322 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	BDKRB2	P30411	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	VHL	P40337	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PTGFR	P43088	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MTNR1B	P49286	362 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	UBE2E1	P51965	193 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GPR50	Q13585	617 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IRF3	Q14653	427 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RHOV	Q96L33	236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GPER1	Q99527	375 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	MGST3	O14880	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RGS10	O43665	173 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PSPN	O60542	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RBP4	P02753	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GABRR1	P24046	479 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DUSP1	P28562	367 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TGFBR2	P37173	567 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	GRK1	Q15835	563 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		Q6YL49	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A0G2JK05	382 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL55-233	ENST00000495899	DEGS1	O15121	323 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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