RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TOMM40LQ969M1 308 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 F8VVB4 439 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 F8VWA3 439 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FGF16O43320 207 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TNFSF15O95150 251 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 LY86O95711 162 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ASCL4Q6XD76 172 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZPA2 131 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OSR2Q8N2R0 312 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 STOML3Q8TAV4 291 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TMEM45BQ96B21 275 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C3orf80F5H4A9 247 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CA11O75493 328 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FCGR3AP08637 254 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HAAOP46952 286 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FUT6P51993 359 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ARL6IP1Q15041 203 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR8B8Q15620 311 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SP6Q3SY56 376 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ARL11Q969Q4 196 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 GPR87Q9BY21 358 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C5orf49A4QMS7 147 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CD79AP11912 226 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF708P17019 499 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FXYD4P59646 89 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR2B8PP59922 312 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 POC1AQ8NBT0 407 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C2orf50Q96LR7 162 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GV50 99 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 SYNGR4O95473 234 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NGFP01138 241 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PPA1Q15181 289 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 HES3Q5TGS1 186 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.08□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ESPL1Q14674 2120 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PR64 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRV1 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 IFNA2P01563 188 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 S100A6P06703 90 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF44P15621 663 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NQO2P16083 231 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NME2P22392 152 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PTAFRP25105 342 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 CD80P33681 288 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SMCO1Q147U7 214 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A25Q6T423 547 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF611Q8N823 705 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RGCCQ9H4X1 137 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 BCO1Q9HAY6 547 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HSF4Q9ULV5 492 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MED12LQ86YW9 2145 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SVILO95425 2214 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 A6NLC8 198 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 COLCA2A8K830 154 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 C21orf140B9A014 251 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 FBXO24O75426 580 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 FAM157CP0CG43 387 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MEOX1P50221 254 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 IL15RAQ13261 267 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 IGFBP7Q16270 282 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms