RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 FGF5P12034 268 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MGAT2Q10469 447 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM56Q96MV1 263 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GPR27Q9NS67 375 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 AGFG2O95081 481 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 BPIFB3P59826 476 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ASB13Q8WXK3 278 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MSL2Q9HCI7 577 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CACNA1AO00555 2505 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 UPK3AO75631 287 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 COL19A1Q14993 1142 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TREM2Q9NZC2 230 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R2P9O14990 202 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TSPAN2O60636 221 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PTP4A3O75365 173 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ONECUT2O95948 504 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CTSBP07858 339 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ASCL1P50553 236 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2D2Q9H210 308 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PNPP00491 289 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FGF7P21781 194 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RAB5CP51148 216 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RAB32Q13637 225 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MITD1Q8WV92 249 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PI4KAP42356 2102 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PR77 199 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PRD5 423 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PRF3 423 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PRM7 423 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NUDT19A8MXV4 375 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C16orf97H3BN30 126 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 BCL2L11O43521 198 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NGFRP08138 427 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2B8PP59922 312 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CACNG5Q9UF02 275 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 COX7A2P2O60397 106 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SFT2D2O95562 160 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFA6P56556 154 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 DOCK7Q96N67 2140 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RAB18Q9NP72 206 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.74□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SCGB1D1O95968 90 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR5AC1P0C628 307 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 LTBRP36941 435 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RAB7AP51149 207 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 IGFBP7Q16270 282 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR6S1Q8NH40 331 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR5B3Q8NH48 314 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C20orf202A1L168 122 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 J3QT63 122 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ADAP1O75689 374 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NAA60Q9H7X0 242 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf170A2RU37 121 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TSTD3H0UI37 97 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 M0QZ24 198 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2C1O95371 312 aa11.73□□□□□ -0.53
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